MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 1084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	CTT	3	9	24	32	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950742
2	NC_022354	CAT	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950742
3	NC_022354	TGC	2	6	50	55	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543950742
4	NC_022354	TTG	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950742
5	NC_022354	CTT	2	6	84	89	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950742
6	NC_022354	GCA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543950742
7	NC_022354	TCA	3	9	111	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950742
8	NC_022354	ATTG	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	543950742
9	NC_022354	ATTT	2	8	175	182	25 %	75 %	0 %	0 %	543950742
10	NC_022354	TC	3	6	221	226	0 %	50 %	0 %	50 %	543950742
11	NC_022354	CTT	2	6	237	242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950742
12	NC_022354	TTTGTG	2	12	267	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950742
13	NC_022354	TC	3	6	346	351	0 %	50 %	0 %	50 %	543950742
14	NC_022354	TAT	2	6	355	360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950742
15	NC_022354	TGA	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950742
16	NC_022354	GTTC	2	8	420	427	0 %	50 %	25 %	25 %	543950742
17	NC_022354	TTG	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950742
18	NC_022354	TA	3	6	675	680	50 %	50 %	0 %	0 %	543950743
19	NC_022354	CTAAAT	2	12	698	709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543950743
20	NC_022354	T	6	6	717	722	0 %	100 %	0 %	0 %	543950743
21	NC_022354	ACT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950743
22	NC_022354	TCT	2	6	771	776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950743
23	NC_022354	TTC	2	6	797	802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950743
24	NC_022354	T	6	6	833	838	0 %	100 %	0 %	0 %	543950743
25	NC_022354	T	8	8	882	889	0 %	100 %	0 %	0 %	543950743
26	NC_022354	ATT	3	9	892	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950743
27	NC_022354	TAA	2	6	910	915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950744
28	NC_022354	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	543950744
29	NC_022354	AAG	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543950744
30	NC_022354	ACT	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950744
31	NC_022354	TTTCTC	2	12	1100	1111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950744
32	NC_022354	ATC	2	6	1145	1150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950744
33	NC_022354	AAT	3	9	1214	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950744
34	NC_022354	TTA	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950744
35	NC_022354	CTTT	2	8	1230	1237	0 %	75 %	0 %	25 %	543950744
36	NC_022354	AAT	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950744
37	NC_022354	ACC	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950744
38	NC_022354	T	8	8	1297	1304	0 %	100 %	0 %	0 %	543950744
39	NC_022354	A	6	6	1371	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	543950744
40	NC_022354	ACC	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950744
41	NC_022354	T	6	6	1430	1435	0 %	100 %	0 %	0 %	543950744
42	NC_022354	ACA	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950744
43	NC_022354	AAAT	2	8	1519	1526	75 %	25 %	0 %	0 %	543950745
44	NC_022354	TCT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950745
45	NC_022354	TA	3	6	1640	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	543950745
46	NC_022354	AT	3	6	1657	1662	50 %	50 %	0 %	0 %	543950745
47	NC_022354	CAT	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950745
48	NC_022354	TCT	2	6	1677	1682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950745
49	NC_022354	TTTA	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	543950745
50	NC_022354	TAT	3	9	1760	1768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950745
51	NC_022354	TTA	2	6	1783	1788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950746
52	NC_022354	TCT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
53	NC_022354	CTCTTT	2	12	1843	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
54	NC_022354	TCT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
55	NC_022354	T	6	6	1909	1914	0 %	100 %	0 %	0 %	543950746
56	NC_022354	ATA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950746
57	NC_022354	CAT	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
58	NC_022354	ATC	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
59	NC_022354	GTT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950746
60	NC_022354	ATC	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
61	NC_022354	CTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
62	NC_022354	T	7	7	2117	2123	0 %	100 %	0 %	0 %	543950746
63	NC_022354	A	7	7	2164	2170	100 %	0 %	0 %	0 %	543950746
64	NC_022354	TCT	3	9	2198	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
65	NC_022354	AAC	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950746
66	NC_022354	T	6	6	2318	2323	0 %	100 %	0 %	0 %	543950746
67	NC_022354	TAC	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
68	NC_022354	TCC	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950747
69	NC_022354	A	6	6	2394	2399	100 %	0 %	0 %	0 %	543950747
70	NC_022354	AAC	2	6	2424	2429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950747
71	NC_022354	TCA	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
72	NC_022354	TAAA	2	8	2508	2515	75 %	25 %	0 %	0 %	543950747
73	NC_022354	T	6	6	2533	2538	0 %	100 %	0 %	0 %	543950747
74	NC_022354	ATTT	2	8	2571	2578	25 %	75 %	0 %	0 %	543950747
75	NC_022354	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	543950747
76	NC_022354	ATA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950747
77	NC_022354	TAA	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950747
78	NC_022354	ATAA	2	8	2730	2737	75 %	25 %	0 %	0 %	543950747
79	NC_022354	AGATA	2	10	2757	2766	60 %	20 %	20 %	0 %	543950747
80	NC_022354	ATC	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
81	NC_022354	ACT	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
82	NC_022354	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	543950747
83	NC_022354	CTA	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
84	NC_022354	T	7	7	2843	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	543950747
85	NC_022354	ATC	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950748
86	NC_022354	CTT	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
87	NC_022354	GTCCTC	2	12	4127	4138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543950748
88	NC_022354	CT	3	6	4146	4151	0 %	50 %	0 %	50 %	543950748
89	NC_022354	TC	3	6	4176	4181	0 %	50 %	0 %	50 %	543950748
90	NC_022354	TCT	2	6	4186	4191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
91	NC_022354	ATA	2	6	4233	4238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950748
92	NC_022354	CCA	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950748
93	NC_022354	CTT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
94	NC_022354	CTT	2	6	4402	4407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
95	NC_022354	TCT	2	6	4427	4432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
96	NC_022354	TCC	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950748
97	NC_022354	GACT	2	8	4557	4564	25 %	25 %	25 %	25 %	543950748
98	NC_022354	CA	3	6	4568	4573	50 %	0 %	0 %	50 %	543950748
99	NC_022354	ATA	2	6	5009	5014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950749
100	NC_022354	A	6	6	5054	5059	100 %	0 %	0 %	0 %	543950749
101	NC_022354	TTC	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950749
102	NC_022354	TCC	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950749
103	NC_022354	ACTT	2	8	5168	5175	25 %	50 %	0 %	25 %	543950749
104	NC_022354	A	6	6	5256	5261	100 %	0 %	0 %	0 %	543950749
105	NC_022354	CG	3	6	5272	5277	0 %	0 %	50 %	50 %	543950749
106	NC_022354	TCT	2	6	5295	5300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950749
107	NC_022354	AGTA	2	8	5340	5347	50 %	25 %	25 %	0 %	543950749
108	NC_022354	CTCA	2	8	5504	5511	25 %	25 %	0 %	50 %	543950749
109	NC_022354	CAT	2	6	5530	5535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950749
110	NC_022354	TTCC	2	8	5572	5579	0 %	50 %	0 %	50 %	543950749
111	NC_022354	CAT	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950749
112	NC_022354	CAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950749
113	NC_022354	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543950749
114	NC_022354	CCA	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950749
115	NC_022354	TA	3	6	5683	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	543950749
116	NC_022354	TTCC	2	8	5704	5711	0 %	50 %	0 %	50 %	543950749
117	NC_022354	T	6	6	5744	5749	0 %	100 %	0 %	0 %	543950749
118	NC_022354	ACAA	2	8	5865	5872	75 %	0 %	0 %	25 %	543950750
119	NC_022354	TGT	2	6	5879	5884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950750
120	NC_022354	TCTA	2	8	6031	6038	25 %	50 %	0 %	25 %	543950750
121	NC_022354	T	6	6	6094	6099	0 %	100 %	0 %	0 %	543950750
122	NC_022354	TCA	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950750
123	NC_022354	CA	3	6	6277	6282	50 %	0 %	0 %	50 %	543950750
124	NC_022354	A	6	6	6326	6331	100 %	0 %	0 %	0 %	543950750
125	NC_022354	AGT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950750
126	NC_022354	GTT	2	6	6435	6440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950750
127	NC_022354	T	6	6	6439	6444	0 %	100 %	0 %	0 %	543950750
128	NC_022354	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543950750
129	NC_022354	GA	3	6	6660	6665	50 %	0 %	50 %	0 %	543950750
130	NC_022354	ATT	2	6	6758	6763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950750
131	NC_022354	TAA	2	6	6782	6787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950750
132	NC_022354	TCTT	2	8	6800	6807	0 %	75 %	0 %	25 %	543950750
133	NC_022354	A	6	6	6853	6858	100 %	0 %	0 %	0 %	543950750
134	NC_022354	TAGATT	2	12	6871	6882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543950750
135	NC_022354	A	6	6	6884	6889	100 %	0 %	0 %	0 %	543950750
136	NC_022354	TACT	2	8	6909	6916	25 %	50 %	0 %	25 %	543950750
137	NC_022354	T	6	6	6940	6945	0 %	100 %	0 %	0 %	543950750
138	NC_022354	T	6	6	6962	6967	0 %	100 %	0 %	0 %	543950750
139	NC_022354	CTTG	2	8	6993	7000	0 %	50 %	25 %	25 %	543950750
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253	NC_022354	TAT	2	6	12520	12525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950754
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259	NC_022354	TTGTT	2	10	12679	12688	0 %	80 %	20 %	0 %	543950754
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267	NC_022354	TAA	2	6	12990	12995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950754
268	NC_022354	TTAA	2	8	13013	13020	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
269	NC_022354	T	6	6	13030	13035	0 %	100 %	0 %	0 %	543950754
270	NC_022354	T	6	6	13054	13059	0 %	100 %	0 %	0 %	543950754
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272	NC_022354	TA	3	6	13075	13080	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
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404	NC_022354	A	6	6	17659	17664	100 %	0 %	0 %	0 %	543950758
405	NC_022354	TTG	2	6	17670	17675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950758
406	NC_022354	T	7	7	17685	17691	0 %	100 %	0 %	0 %	543950758
407	NC_022354	AGTT	2	8	17708	17715	25 %	50 %	25 %	0 %	543950759
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